Want Left nav items for permissions , apps  ,your apps, apps you can add , sharepoint 2013 ,

 in system pages .

Solution : Add this code to your master page 

<div id="sideNavBox" class="ms-dialogHidden ms-forceWrap ms-noList">

                                                <a id="startNavigation" name="startNavigation" tabIndex="-1">

                                                </a>

                                                <!--SPM:<SharePoint:AjaxDelta id="DeltaPlaceHolderLeftNavBar" Visible="true" class="ms-core-navigation ms-belltown-sideNavDelta" BlockElement="true" runat="server">-->

                                                <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder id="PlaceHolderLeftNavBar" Visible="true" runat="server">-->

                                                <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder id="PlaceHolderLeftNavBarTop" Visible="true" runat="server"/>-->

                                                <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder id="PlaceHolderQuickLaunchTop" Visible="true" runat="server"/>-->

                                                <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder id="PlaceHolderLeftNavBarDataSource" Visible="true" runat="server"/>-->

                                                <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder id="PlaceHolderCalendarNavigator" Visible="true" runat="server"/>-->

                                                <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder id="PlaceHolderLeftActions" Visible="true" runat="server"/>-->

                                                <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder id="PlaceHolderQuickLaunchBottom" Visible="true" runat="server"/>-->

                                                <!--SPM:</asp:ContentPlaceHolder>-->

                                                <!--SPM:</SharePoint:AjaxDelta>-->

                                            </div>